Препаративный электрофорез нуклеиновых кислот и белков

 

Компания Sage Science производит линейку приборов для автоматизированного разделения и выделения фрагментов нуклеиновых кислот или белков при помощи препаративного электрофореза.

 Чтобы предотвратить деградацию целевых молекул, их детекция происходит без применения ультрафиолетового света, с помощью светодиодного детектора. Отбор образцов происходит автоматически, в соответствии с заданными параметрами.

Приборы Pippin Prep и BluePippin

В приборах Pippin Prep и BluePippin используются готовые кассеты на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем. В конце каждого капилляра есть Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре происходит под действием тока. При приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в специальной камере. Каналы, в которых происходит электрофорез, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации. Отбор образцов из пробоотборной камеры производится вручную с помощью стандартного дозатора.

Прибор Pippin Prep

Pippin Prep  — прибор для выделения фрагментов ДНК размером от 100 п.н. до 1 500 п.н. Подготовка образцов занимает 3 минуты, время процедуры выделения фрагментов ДНК — 50-90 минут. Возможность пульс-электрофореза не предусмотрена. Максимальное количество образцов — 5 шт.

Типы кассет и диапазон выделяемых фрагментов ДНК:

3% агароза, 100-250 п.н.;

2% агароза, 100-600 п.н.;

1,5% агароза, 250-1 500 п.н.

Применение для следующих методов:

секвенирование спаренных концов;

эмульсионная ПЦР;

РНК-секвенирование;

ChIP-секвенирование;

выделение микроРНК.

PIP0001 ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКАЯ ГОРИЗОНТАЛЬНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ПРЕПАРАТИВНОГО ЭЛЕКТРОФОРЕЗА ДНК/РНК, PIPPIN

Прибор BluePippin

BluePippin— прибор для выделения фрагментов ДНК размером от 100 п.н. до 50 000 п.н. Подготовка образцов занимает 3 минуты, время процедуры выделения фрагментов ДНК — 50-90 минут. Предусмотрена возможность пульс-электрофореза (процедура занимает до нескольких часов). Максимальное количество образцов — 5 шт.

В приборе BluePippin возможно использование не только стандартных кассет, но и кассет High Pass Plus, специально разработанных для выделения крупноразмерных фрагментов ДНК.

Типы кассет и диапазон выделяемых фрагментов ДНК:

3% агароза, 100-250 п.н.;

2% агароза, 100-600 п.н.;

1,5% агароза, 250-1 500 п.н.;

0,75% агароза, 1 000-50 000 п.н.;

High Pass Plus, 15 000-50 000 п.н.

Применение для следующих методов:

секвенирование спаренных концов;

секвенирование геномов единичных молекул;

РНК-секвенирование;

ChIP-секвенирование;

выделение микроРНК;

секвенирование протяженных участков генома (PacBio, Oxford Nanopore).

BLU0001 ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКАЯ СИСТЕМА BLUEPIPPIN ДЛЯ ПРЕПАРАТИВНОГО ЭЛЕКТРОФОРЕЗА ДНК/РНК/БЕЛКОВ

Прибор Pippin HT

PippinHT– прибор для выделения фрагментов ДНК размером от 100 п.н. до 40 000 п.н. Подготовка образцов занимает 3 минуты, время процедуры выделения фрагментов ДНК – 25-45 минут. Предусмотрена возможность пульс-электрофореза (процедура занимает до нескольких часов). Имеется возможность отбора фрагментов ДНК больше (High-Pass Size Filtering) и меньше (Low-Pass Size Filtering) заданного порога. Максимальное количество образцов – 24 шт.

Типы кассет и диапазон выделяемых фрагментов ДНК:

3% агароза, 100-250 п.н.;

2% агароза, 100-600 п.н.;

1,5% агароза, 250-1 500 п.н.;

0,75% агароза, 6 000-40 000 п.н.

Применение для следующих методов:

секвенирование спаренных концов;

секвенирование геномов единичных молекул;

РНК-секвенирование;

ChIP-секвенирование;

выделение микроРНК.

HTP0001 ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКАЯ ГОРИЗОНТАЛЬНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ПРЕПАРАТИВНОГО ЭЛЕКТРОФОРЕЗА ДНК/РНК/БЕЛКОВ

Прибор SageHLS

SageHLS — прибор, который позволяет получать высокомолекулярную ДНК. В лунки агарозного геля помещаются суспензии клеток, лизис которых происходит во время электрофореза. В результате белки электрофоретически удаляются из геля, а интактная ДНК фиксируется в агарозе. Последующий ферментативный гидролиз расщепляет ДНК на фрагменты, пригодные для разделения в геле при помощи пульс-электрофореза. После разделения изменяется направление тока (перпендикулярно предыдущему) и фрагменты делятся на шесть размеров, перемещаясь в пробоотборные камеры. Максимальное количество образцов — 4 шт.

Процедура разделения происходит в одной или двух гелевых кассетах. В каждой кассете происходит выделение ДНК из двух образцов.

Время процедуры:

экстракция ДНК — 60 мин;

ферментативный гидролиз ДНК — 30 минут;

электрофорез и разделение фрагментов на размеры — 1-6 часов.

Применение для следующих методов:

оптическое картирование;

секвенирование протяженных участков генома (PacBio, Oxford Nanopore).

Прибор SageELF

SageELF — прибор для фракционирования образцов ДНК (100-40 000 п.н.) или белков (10-500 кДа) по размеру, и последующего разделения всего образца или его частей на 12 фракций. Целевой фрагмент собирается в отдельную лунку и отбирается стандартной пипеткой. Предусмотрена возможность пульс-электрофореза для разделения крупных фрагментов ДНК. Процедура разделения происходит в одной или двух гелевых кассетах. В каждой кассете разделяются фрагменты одного образца. Максимальное количество образцов — 2 шт.

Типы кассет и диапазон выделяемых фрагментов ДНК или белков:

2% агароза, 100-2 300 п.н.;

0,75% агароза, 1 000-18 000 п.н.;

0,75% агароза, 10 000-40 000 п.н.;

5% SDS-агароза – 10-100 кДа;

3% SDS-агароза – 50-500 кДа.

Применение для следующих методов:

секвенирование спаренных концов;

РНК-секвенирование;

ДНК-секвенирование;

масс-спектрометрия белков;

анализ белковых комплексов.

ELF0001 ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКАЯ ГОРИЗОНТАЛЬНАЯ СИСТЕМА ДЛЯ ФРАКЦИОНИРОВАНИЯ БЕЛКОВ, ДНК/РНК, SAGE ELF

Прибор Pippin Pulse

Pippin Pulse — источник питания для проведения пульс-электрофореза. Позволяет разделять фрагменты ДНК размеров 100 000 п.н. и более. Имеет простой программный интерфейс, обеспечивающий пользователям разрабатывать собственные протоколы пульс-электрофореза. Рабочий диапазон от 25 до 175 В и до 200 мА. Дополнительно может поставляться камера для электрофореза и 10× KBB-буфер на основе Tris-TAPS.